Aukštaitijos krašto keliai minimi jau Livonijos kronikose. XIII a. pabaigoje buvo žinomi keliai, jungiantys Rytų Prūsiją su Ryga. Apie per Panevėžį ėjusį prekybos kelią – traktą iš Vilniaus į Rygą – rašoma XVI a. Pašto traktas Šiauliai – Panevėžys – Vilnius išsilaikė nuo XIX a. iki pat Pirmojo pasaulinio karo.

   Pirmasis kelias su kietąja danga, ėjęs per Panevėžį, buvo Aukštaičių plentas, nutiestas 1935 –1940 m. Nepriklausomos Lietuvos metais, kai 1919 m. įsteigta Centrinė plentų valdyba kūrė kelių aptarnavimo organizacijų tinklą, buvo įkurtas Panevėžio kelių rajonas.

   Pirmosios kelius prižiūrinčios organizacijos dabartinėje Panevėžio apskrityje Panevėžyje, Rokiškyje ir Pasvalyje buvo įsteigtos 1944 m. rugpjūčio mėnesį. Tolesnių reorganizacijų metu 1956 m. Panevėžio kelių eksploatavimo rajonas buvo sujungtas ir kartu su kitais rajonais pervardintas į KSER (kelių statybos ir eksploatavimo rajoną).

   1959 m. kiekviename rajono centre buvo suformuota po savarankišką kelių organizaciją, įkurti Biržų ir Kupiškio kelių ruožai. Vienai įmonei priklausė visi rajone esantys valstybiniai keliai. Per 1959–1995 m. susiformavo dabartinis kelių tinklas, susikūrė ir išaugo pajėgios gamybinės technikos bazės, kelininkai įsigijo šiuolaikinės technikos, įsisavino sudėtingas kelių priežiūros ir statybos technologijas.

   Atkūrus Lietuvos nepriklausomybę 1995 m. buvo atlikta kelius prižiūrinčių įmonių reorganizacija. Panevėžio apskrityje esančios Pasvalio, Rokiškio, Biržų, Kupiškio ir Panevėžio kelių valdybos buvo sujungtos į vieną organizaciją – valstybinę įmonę "Panevėžio regiono keliai". Pirmuoju įmonės vadovu buvo paskirtas J. Grigalius. Rajonų centruose buvusios kelių valdybos tapo VĮ "Panevėžio regiono keliai" padaliniais – kelių tarnybomis.

   1996 m. birželio mėn. įmonės direktoriumi paskiriamas R. Žagaras.